גדוד רותם הוא הגדוד הצעיר מבין שלושת הגדודים של החטיבה. הוא הוקם בשנת 1984, כשהשאר הוקמו ב-1983. גדוד רותם נקרא על שם הצמח "רותם", הגדל במדבר.